Başkanlığımızın ana misyonu; Bakanlığımız fiziki yapısı ile ilgili düzenlemeleri gerçekleştirmenin yanında, bir destek birimi olarak Bakanlığımız diğer Birimlerince çözüme bağlanamayan ya da bağlanması mümkün olmayan hizmetleri yerine getirmektir. Başkanlığımız, görevi gereği üstlendiği faaliyetlerin tamamı üzerinde uzun yıllar çalışmasının sonucu elde ettiği birikimi tecrübeye, tecrübeyi bilgiye bilgiyi ise uzmanlığa dönüştürerek ciddi bir beceriye sahip olmayı başarmıştır.
Başkanlığımız kendisi için stratejik olarak iki temel vizyona sahiptir.
I. İnsan gücünün teknolojik yeniliklere ve mevzuat değişikliklerine uyumunun sağlanması yoluyla nitelikli iş gören haline getirilerek kurumsal yapıdaki gizli işsizliğin azaltılması,
II. Bakanlığımız diğer birimlerinin yeni mali sistemlere uyumunun sağlanması ve bütün Bakanlık personelinin çağdaş niteliklere kavuşturularak birimin fonksiyonel anlamda çağdaş mali yapıyı benimsemesinin temini,
Başkanlığımızın diğer birim yetkililerinin her türlü iş ve işlemlerinde danışmanlık yapması; gerektiği zamanlarda birebir refakat ederek yardımcı olması öğrenmenin kalıcı hale gelmesini temin çabaları, bu vizyonumuza yönelik çalışmalardır.